В простейшем клиническом варианте провокационная проба выполняется по следующей методике. Обследование проводится утром, натощак, после предварительного осмотра больного. Затем ребенку дают съесть или выпить небольшое количество проверяе­мого продукта, например, 50—100 мл пастеризованного молока, и наблюдают ребенка в течение 2 час. В этом временном диапазоне возникают острые симптомы заболевания, которые регистрируют­ся как результат провокационной пробы. Если же состояние ре­бенка за это время никак не изменилось, вывод об отрицательных результатах тем не менее еще не делают, а отправляют ребенка домой после специального инструктажа матери. Этот инструктаж заключается в том, что матери объясняют, какие симптомы могут возникнуть у ребенка и что надо сделать, чтобы их погасить.

Про­ба считается отрицательной, если симптомы не появились в тече­ние 3 дней. Однако не во всех случаях пищевой аллергии ее симпто­мы связаны с острыми, немедленными реакциями. Нередко они развиваются по замедленному типу. Особенно часто такой фено­мен приходится наблюдать при аллергической непереносимости зерновых продуктов (каш, макаронных изделий, хлеба). В этих случаях целесообразно проводить нагрузочную провокационную пробу. Делается она так. После периода исключения (элимина­ции) рекомендуют ежедневно на протяжении недели использовать в диете ребенка проверяемый продукт. Например, при возможной непереносимости манной каши давать эту кашу, сваренную на во­де, ежедневно 5—7 дней подряд при условии исключения на эти дни всех других каш. Если пищевой аллерген, в данном случае пшеница, предугадан верно, то симптомы заболевания за дни этой проверки постепенно вернутся.
В условиях специализированного медицинского учреждения провокационные пробы выполняются более сложно и подкрепляют­ся лабораторными или инструментальными исследованиями, такими, как лейкопеническая проба, тромбоцитопенический тест, провокационные пробы, сочетающиеся с фиброскопическими иссле­дованиями желудочно-кишечного тракта. Сравнивая слизистую оболочку до и после провокации можно выявить повреждающее действие аллергена на тканях.